- Администрация (главный врач, его заместители)
- Приёмное отделение
- Отделение реанимации и интенсивной терапии;
- Инфекционные боксированные отделения
- 1-е отделение
- 2-е отделение
- 3-е отделение
- 4-е отделение
- 5-е отделение
- Отделение лучевой диагностики
- Амбулаторное отделение с дневным стационаром
- Лечебно-диагностические кабинеты:
- функциональной диагностики
- гинекологический
- хирургический
- динамического наблюдения и реабилитации реконвалесцентов острых инфекционных заболеваний (острые вирусные гепатиты)
- Лабораторная служба:
- бактериологическая лаборатория
- клинико-диагностическая лаборатория
- микробиологическая лаборатория (лаборатория иммуноферментных методов и молекулярно-генетической диагностики)
- Организационно-методический отдел
- Эпидемиологический отдел
- Клинико-экспертный отдел
- Вспомогательные подразделения и параклинические службы