1. Администрация (главный врач, его заместители)
  2. Приёмное отделение
  3. Отделение реанимации и интенсивной терапии;
  4. Инфекционные боксированные отделения
    • 1-е отделение
    • 2-е отделение
    • 3-е отделение
    • 4-е отделение
  5. Лечебно-диагностическое отделение с дневным стационаром
  6. Лечебно-диагностические кабинеты:
    • физиотерапевтический
    • функциональной диагностики
    • гинекологический
    • хирургический
    • рентгенологический
    • иммунологический
    • консультативно-диагностический
    • динамического наблюдения и реабилитации реконвалесцентов инфекционных заболеваний.
  7. Лабораторная служба — бактериологическая лаборатория — клинико-диагностическая лаборатория — микробиологическая лаборатория (лаборатория иммуноферментных методов и молекулярно-генетической диагностики, ПЦР)
  8. Организационно-методический отдел
  9. Эпидемиологический отдел
  10. Клинико-экспертный отдел
  11. Вспомогательные подразделения и параклинические службы